商标异议申请的流程主要包括以下几个步骤：

提出异议：对初步审定公告的商标，自公告之日起三个月内，相关权利人可以向商标局提出异议。在提出异议时，需要填写《商标异议书》，写明被异议商标的名称、商品类别、初步审定号、初步审定公告期号以及提出异议的具体理由。
通知答辩：商标局在收到异议书及有关证据后，会将异议书副本寄达被异议人。被异议人应在收到异议书之日起三十天内作出书面答辩。如果被异议人在限期内未作出答辩，将被视为弃权，但这并不影响异议程序的进行。
补正（非必经流程）：如果在收到异议申请后，商标局发现异议申请书件中存在问题需要补正的，将向异议人或商标代理机构寄发补正通知，要求其在限期内补正。
做出裁定：商标局在听取异议人和被异议人的陈述事实和理由后，会进行调查核实。经调查核实后，商标局会在自公告期满之日起十二个月内做出是否准予注册的决定，并书面通知异议人和被异议人。
此外，商标异议申请还可以通过以下方式办理：

委托商标代理机构办理：签署商标代理委托书，并附异议人的身份证明（如营业执照、身份证等）；准备异议材料，包括异议申请书、异议理由及事实依据并附相关证据；由商标代理机构代异议人向商标局提交异议申请材料。
直接到商标注册大厅办理：准备异议申请材料，包括异议申请书、异议理由及事实依据，并附相关证据；在商标注册大厅提交申请材料；在打码窗口打收文条形码；在交费窗口缴纳异议规费。
通过邮寄材料办理：准备异议申请材料，包括异议申请书（网上下载即可）、异议理由及事实依据，并附相关证据；通过邮局以挂号或特快专递方式邮寄到商标局。
以上信息仅供参考，具体流程可能会因实际情况而有所不同。如有需要，建议您咨询专业的商标代理机构或法律人士。